根据相关资料显示，一般情况下，醉驾检察院不起诉的确会留有案底。虽然被免除了刑事处罚，但是行政处罚方面，交管部门会对醉驾者采取相应措施，比如吊销驾驶证以及禁止重新考取新驾照等，这种行政处罚也会有相应的案底。
尽管如此，从长远来看，这种行政处罚的案底并不会对当事人的工作和生活产生太大影响。根据《刑法》第一百三十三条规定，醉驾属于刑事责任范畴。然而，在实际执法中，若醉驾情节不严重，一般不会给予定罪处罚，即使已经追究刑事责任的案件，也可能会撤销或不予起诉。
这主要基于《刑法》第十六条第一项的规定，即驾驶行为人情节不严重、未造成太大危害时，不会认定为犯罪行为。因此，在这种情况下，也就不会形成实质性的犯罪记录。
然而，需要注意的是，虽然醉驾不起诉在刑事责任上可能没有直接影响，但其行政处罚的案底还是存在的。根据《道路交通安全法》规定，喝醉酒驾驶机动车将受到约束至酒醒，并依法撤销驾驶证，同时可能会追究相应的刑事责任。
此外，若机动车所有人管理人对醉驾行为在第三项及第四项方面负有直接责任，也会按照法律规定进行相应处罚。
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